GeneXpert? 系統將樣品制備和定量PCR過程整合在一個封閉試劑盒中并自動完成，能夠自動完成樣品制備、核酸純化濃縮、定量PCR擴增檢測，并輸出分析結果，整個過程手工操作不到一分鐘，從樣本制備到結果只需要兩個小時。與傳統的熒光定量PCR相比，GeneXpert? 實現了5大突破：
1. 突破傳統PCR的空間限制，實現從”PCR in System“到”PCR in Cartridge“的革新。從樣本清洗、核酸提取及純化、核酸與PCR試劑的混合到核酸的擴增及實時熒光檢測都在試劑盒中閉管完成。儀器內置的細胞破碎模塊，以及儀器與試劑間沒有任何“濕”接觸，GeneXpert? 從設計理念上確保整個PCR 過程沒有污染風險，破解污染造成的假陽性難題。
2. 突破傳統PCR儀單機檢測項目的局限
現有的其他PCR平臺，不能同時兼顧所有臨床領域的檢測，因而為了檢測不同的項目，就需要配備多個不同的PCR儀器，增加成本的同時也不利于標準化的操作。在GeneXpert?上，公司現有的所有檢測項目都是基于該平臺開發的，覆蓋了院內感染、危重感染、腫瘤、女性健康、性傳播疾病、遺傳性疾病、免疫抑制性疾病等多個臨床領域。統一的操作平臺節約成本的同時，也便于實驗室的標準化管理。
3. 突破傳統PCR試驗操作“高難”的限制
GeneXpert? 的手工操作時間不超過1分鐘，樣本清洗、核酸提取純化都由GeneXpert? 自動完成，避免了傳統PCR繁瑣的樣本手工制備過程，只需一天不到的簡單培訓便可掌握。美國CLIA對GeneXpert? 的評級為中度復雜，是經過簡單培訓即可有資格操作的診斷技術，無需PCR證。
4. 突破了傳統PCR一款儀器通量或大或小的限制
在GeneXpert? 系統中，所有的模塊是可以用于任意機型的，可根據實際的檢測量不斷升級。目前國內上市的機型中最大通量的是80 個通道，每日可檢測2000份標本。
5. 突破了傳統PCR敏感性與特異性不能兼得的魔咒
GeneXpert? 的性能在全球由大量的數據驗證，靈敏度接近100%的同時，特異性也接近100%。
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